1、水产养殖中有害细菌种类繁多，主要包含弧菌、链球菌、假单胞菌、气单胞菌、诺卡氏菌、爱德华氏菌、变形菌、黄杆菌、嗜纤维菌、肾杆菌、巴斯德菌等，其中常见的有害菌有溶藻胶弧菌、哈氏弧菌、创伤弧菌、副溶血弧菌、气单胞菌（如嗜水气单胞菌）、链球菌（如海豚链球菌）等。
2、在水产养殖中，应尽可能地控制有害菌的繁殖与蔓延，并正确处理与有益菌之间的关系。当有益菌与有害菌之间的平衡被打破时，需要进行人工干预，通过添加有益菌制剂来恢复其平衡。
二、冬季水产养殖的注意事项
1、防冻害
（1）冬季气温低，最害怕的就是冻害，可以在池塘西北边设置挡风墙，用木桩围上编织袋或稻草，这样能避免北方吹，造成水温迅速下降。
（2）在霜冻迹象是，可以用湿稻草、柴禾堆放在岸边生火熏烟，减弱霜冻危害。
（3）也可以在池塘中栽种一定的水草，可以使得鱼虾在水草中越冬，降低低温对其的影响，也可以在晴朗天下午在注入新水，提高水温。
2、不宜傍晚冲水
冬季由于池塘底部厌氧菌发酵原则，如果这时随意打开增氧机或在傍晚冲水的话，底部的水层由于缺氧，傍晚冲水会使得上下水层混合，使得整个池塘缺氧，对于鱼虾造成极大的危害，所以不宜傍晚冲水。
3、适当投喂
（1）11月气温在20度注意，是淡水鱼虾的生长旺盛，这时为其提供充足的天然饵料，不仅能保膘长胖，还能为淡水鱼圆满过冬打下基础。投喂要遵循“定期、精准定位、定质、定量分析”的标准进行，投喂量根据气温、水体以及鱼虾进食情况灵活掌握。
（2）饵料要营养价值全方位，鲜美性强，新鮮不霉变，保证鱼虾吃饱吃好，又不造成浪费，污染水体。
4、消毒改底
（1）在鱼种下塘前，需要对其体表进行消毒，可以旺碘进行药浴5分钟，下塘后，连续使用两天应激灵进行抗应激处理。
（2）冬季的池塘经过一年的养殖，底部会沉积非常多的残饵和粪便，厌氧发酵会产生到有毒气体，对于鱼虾产生严重的毒害，所以在冬季应该及时投放久氧和强底净进行改底增氧，避免底部环境恶化。
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